本来这个问题真的没必要写的，可是真的困扰我太久%>_

首先，最权威清晰的安装文档还是官方的：

那这个文档最开始就告诉我们，自NetCDF库4.2版本以后，Fortran的库和C的库就要分开build啦！而且要装Fortran的库必须先装好C的库。

所以先装C的库咯：仍然官方文档：

那这个文档告诉我们：要装NetCDF-C的库，有三个(其实是两个)必须装的：zlib，HDF5，(curl)。

参照官方文档，zlib和hdf5的安装比较简单，指定一下安装路径即可：

build zlib:

$ ./configure --prefix=/home/ed/local

$make check install

build HDF5:

$ ./configure --with-zlib=/home/ed/local --prefix=/home/ed/local

$make check install

其中，比较容易出问题的是HDF5的安装，参阅HDF5官方文档

成功之后，就可以进行netcdf-c和netcdf-fortran库的安装了，这里有个问题要注意：编译安装库时候的编译器要和你以后编译你的Fortran代码使用的编译器一致，否者以后在编译Fortran源代码其中用到netcdf库时会出错。以我为例：我平时用Intel的编译器，所以此时在安装这两个库的时候，分别用Intel C++ Composer和Intel Fortran Composer进行编译(后面简称icc和ifort)

安装好了icc和ifort以后均需要设置一下环境变量：(最好添加到~/.bashrc文件中)

source /bin/compilervars.sh intel64

接下来就是用Intel编译器编译安装netcdf库了：

关键就是设置几个编译选项：

export CC=icc

export CXX=icpc

export CFLAGS=‘-O3 -xHost -ip -no-prec-div -static-intel‘export CXXFLAGS=‘-O3 -xHost -ip -no-prec-div -static-intel‘export F77=ifort

export FC=ifort

export F90=ifort

export FFLAGS=‘-O3 -xHost -ip -no-prec-div -static-intel‘export CPP=‘icc -E‘export CXXCPP=‘icpc -E‘

对于c库：

$ CPPFLAGS=-I/home/ed/local/include LDFLAGS=-L/home/ed/local/lib ./configure --prefix=/home/ed/local

$make check install

对于Fortran库：

首先仍然如上设置编译选项，然后假设你的c库安装在路径${DIR1}：

export LD_LIBRARY_PATH=${DIR1}/lib:${LD_LIBRARY_PATH}

然后和c库的编译过程一样：

CPPFLAGS=-I${DIR1}/include LDFLAGS=-L${DIR1}/lib ./configure --prefix=${DIR1}make

makecheckmake install

原文：http://www.cnblogs.com/fsquared/p/3804863.html